在長期的辦學實踐中，學校秉承“勤求博采、厚德濟生”校訓，倡導“人心向學、傳承創新”理念，堅持“立德樹人、以文化人”宗旨，弘揚“追求卓越、止于至善”精神，彰顯特色、強化優勢，是我國培養高層次創新型中醫藥人才的教育基地、高等中醫藥教育改革的示范基地、中醫藥知識創新和技術創新的研究基地、防治重大疾病和疑難疾患的醫療基地、弘揚優秀傳統文化的人文基地、推進中醫藥走向世界的國際交流基地，為人類健康事業發展和文明進步做出了重要貢獻，已經成為在國內外享有盛譽的集教育、科研、醫療、中醫藥文化傳播于一體的著名中醫藥高等學府。 　　

學校現有教職工5233人，專任教師1478人，其中具有高級專業技術職務者占61.84%，具有碩士以上學位者占84.64%，有博士生導師346人。學校有“國醫大師”6人，“全國名中醫”3人，“首都國醫名師”33人，“973”項目首席科學家4人，國家杰出青年科學基金項目獲得者4人，“長江學者”特聘教授3人，“岐黃學者”9人，國家重點研發計劃“中醫藥現代化研究”重點專項項目負責人7人，“萬人計劃”科技創新領軍人才5人，“萬人計劃”教學名師1人，“千人計劃”青年項目獲得者1人，國家自然科學基金優秀青年科學基金項目獲得者3人，“長江學者”青年學者1人，第七屆國務院學科評議組成員3人，百千萬人才工程國家級人選7人，國家級有突出貢獻中青年專家8人，中醫藥高等學校教學名師4人，享受政府特殊津貼專家134人，形成了一支以國內外著名專家學者和國內有影響的中青年教授為主的師資隊伍。 　　

學校堅持立德樹人根本任務，注重從豐厚的中華文化和中醫藥文化土壤中汲取營養，將“以文化人”理念貫穿于育人工作的始終，培養德智體美勞全面發展的社會主義建設者和接班人。現有全日制在校生12602人，其中研究生4504人，本科生7536人，留學生562人。另有繼續教育學生1864人，遠程教育學生17859人。 　　

學校致力于構建面向未來以高層次教育為主的人才培養體系，目前設有中醫學、中藥學、中藥制藥、藥學、針灸推拿學、康復治療學、公共事業管理（衛生事業）、藥事管理、信息管理與信息系統、護理學、英語（醫學、中醫藥國際傳播）、法學（醫藥衛生）12個本科招生專業。 　　

學校是全國高等中醫藥院校中首批建立博士學位點和博士后科研流動站的單位之一，設有中醫學、中藥學、中西醫結合3個博士后科研流動站。擁有3個一級學科博士學位授權，囊括42個二級學科博士學位授予點，7個一級學科碩士學位授權，囊括45個碩士學位授予點。學校現有一級學科國家重點學科2個，涵蓋二級學科國家重點學科15個，國家中醫藥管理局重點學科48個，一級學科北京市重點學科2個，二級學科北京市重點學科8個。 　　

學校現有3個國家級教學團隊，1個國家級實驗教學示范中心，3個國家級大學生校外實踐教育基地。學校獲得國家級教學成果獎一等獎1項（參與完成）、二等獎2項，北京市教學成果獎一等獎8項、二等獎10項。 　　

學校現有省部級以上科研基地50個。其中國家級國際科技合作基地2個，教育部重點實驗室3個，教育部工程研究中心2個，高等學校學科創新引智基地2個，國家中醫臨床研究基地2個，國家中醫藥管理局三級實驗室14個，國家中醫藥管理局重點研究室10個，國務院臺灣事務辦公室臺灣中醫藥研究基地1個，北京市重點實驗室6個，北京市教委工程研究中心1個，北京市國際科技合作基地6個，北京中醫藥文化研究基地1個。學校獲得國家科技進步二等獎8項，承擔科技部“973計劃”、支撐計劃、重大專項、自然基金重點項目等770余項。中醫體質辨識研究成果作為唯一的中醫成果被納入《國家基本公共衛生服務規范》，《中風病中醫診斷與療效評定標準》成為中醫行業標準和國家標準。 　　

學校現有中醫學院、中藥學院、生命科學學院、針灸推拿學院、管理學院、護理學院、人文學院、馬克思主義學院、國學院、國際學院、臺港澳中醫學部、繼續教育學院、遠程教育學院、體育教學部等教學單位。現有北京中醫藥研究院、北京中醫藥大學國家中醫體質與治未病研究院、北京中醫藥大學國家中醫藥發展與戰略研究院、北京中醫藥大學中醫腦病研究院等校級研究機構。 　　

學校現有第一臨床醫學院（北京中醫藥大學東直門醫院）、第二臨床醫學院（北京中醫藥大學東方醫院）、第三臨床醫學院（北京中醫藥大學第三附屬醫院）3家直屬附屬醫院和國醫堂中醫門診部。近年來，學校遵循“引導醫療衛生工作重心下移、資源下沉”原則，探索合作共建新模式，搭建了區域標志性的高質量中醫藥服務平臺，建立第四臨床醫學院（北京中醫藥大學棗莊醫院）、第五臨床醫學院（北京中醫藥大學深圳醫院）、第六臨床醫學院（北京中醫藥大學房山醫院）、第七臨床醫學院（北京中醫藥大學孫思邈醫院）和第八臨床醫學院（北京中醫藥大學廈門醫院）。另有中日友好醫院、廣安門醫院、西苑醫院、望京醫院、北京中醫醫院等16個臨床教學基地，承擔著全校學生的臨床教學、見習、實習工作。學校現有國家臨床重點專科17個，國家中醫藥管理局重點專科44個。建設有國醫大師傳承工作室6個，全國名中醫傳承工作室3個，全國中醫學術流派傳承工作室2個和全國名老中醫藥專家傳承工作室40個，北京中醫藥“薪火傳承3+3工程”二室一站44個。